2020年04月01日 星期三

广东疾控中心:1月中旬已完成病毒全基因组测序

来源:广东健康头条南方号 2020-02-16 09:57:52 记者:

随着越来越多的科研成果被披露,大众对新冠肺炎病毒的认识逐渐加深,这其中少不了科研攻关团队的功劳。近日,广东省疾控中心首席专家柯昌文和微检所所长武婕接受采访时透露,早在1月中旬广东就从首例确诊者的样本中检测出核酸阳性,并完成全基因组测序。

多年工作经验助力“广东速度”

南方日报、南方+:广东的首株新冠肺炎病毒是如何分离培养出来的?

武婕:实际上,在广东首例确诊者样本确诊阳性后,省疾控中心马上开展全基因组测序才能上送国家进行复核检测。病人样本中的病毒载量非常小,想直接对原始标本中的病毒进行全基因组测序,其难度非常高。但我们做到了,这是除湖北省外的全国首例。

▲省疾控中心分离出广东首株新型冠状病毒毒株

要开展更进一步的研究,就必须要分离出病毒,但新冠病毒的分离培养活动需要向国家申请相关资质,花了近1周的时间获得资质后,我们迅速在三级生物安全实验室中开展实验。

病毒需要在合适的传代细胞中进行培养。这是个全新的病毒,我们只能自己摸索,同时准备了几种不同的细胞系。最终,我们团队凭着多年的工作经验,在vero-E6传代细胞中成功培养出病毒株。

▲出现完全病变的vero-E6传代细胞

南方日报、南方+:大众很好奇,三级生物安全实验室是怎样的?

柯昌文:我们的三级生物安全实验室有300多平方米, 整个实验室完全密封,室内处于负压状态,内部的气体不会泄漏到外部。

实验室分3个核心区,每个核心区可以独立开展研究活动。核心区与核心区之间设有缓冲区,杜绝交叉污染。

南方日报、南方+:病毒株有什么作用?需要每天观测吗?

柯昌文:我们每天都会进实验室,因为病毒是在活细胞中培养的,必须每天观察细胞状态,通过观察细胞病变,确定是否有病毒增殖,还可以做一些病毒浓度测定等。

分离培养病毒的目的是可以更详细了解病毒特征,也为疫苗研制和抗体测定提供资源。

应急检测更需争分夺秒

南方日报、南方+:听起来,实验人员每天都待在实验室里。

柯昌文:不仅如此。我们还会对农贸市场进行采样检测,时刻关注是否存在阳性样本。这对及时调整防控策略非常重要。

武婕:实验室人员到现场采样是工作常态。除了对地市送上来的样本进行核酸复核外,我们经常开展应急检测。我们有同事就在实验室连续工作了36个小时,这些都是工作的常态。

▲大年三十,省疾控中心实验室人员坚守在生物安全三级验室做检验

南方日报、南方+:实验室工作和现场工作,哪个更危险?

武婕:都很危险。到现场采样,面对的是未知的环境和感染者,可能有各种各样的突发事件。

而在实验室中,病毒浓度比外界高很多。一个病例可能只携带几千个、几万个病毒,但是用于培养病毒的细胞里,病毒量可能达到百万级、千万级。而且在P3实验室作业的话需要穿戴厚重的防护服,经过严密的消毒才能进入。因此工作人员往往连续工作五六个小时,无法喝水、吃饭,做完实验时防护服内都湿透了。

南方日报、南方+:在如此高危的环境中工作,心里有压力吗?

武婕:说没有就是骗人的。有一次同时来了几百份样本,处理量非常大,因为都要赶着时间做检测,年轻的同事一下子就急哭了。我只能安慰她,现在是特殊时期,我们可以哭,但哭过了还得接着干活。

▲省疾控中心实验室人员全副武装

坚持用人工提取核酸

南方日报、南方+:现在的检测是怎么做的呢?

武婕:省疾控承担的是一些重点样本的检验任务,要求的是准确性。我们一直采用人工提取核酸。这样的流程很花时间,工作量也很大,但可以提高检测的准确度,我们一直坚持这种方法。

南方日报、南方+:针对新型冠状病毒的科技攻关和检验工作,省内不同机构是如何分工的?

柯昌文:省疾控中心与各市、区级疾控中心、部分医院开展密切的合作,包括一些第三方医学检验机构也参与其中。

省疾控中心可以通过医院获取临床病例标本,做核酸检测,分离病毒;第三方医疗检验机构可以做一些基因测序的工作,可以及时掌握病毒变异的特点。(记者 吴少敏 钟哲)

责任编辑:朱丽芳

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